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每一種組織切片，對于振動的幅度，切片的速度，刀片的角度應放在何處位置，需經過試驗。因為我們處理的是組織本身的硬度而不是支持它的介質，比較硬的組織應切得快些，不要壓它，或從標本臺拉松。幅度足以使切力的側方切去即可，如果太小將使切片破碎。速度以切的組織忍受得住即可。水槽充滿適合的液體，裝上適當性質的刀片。（參看典型參數部分）組織應放在載物臺中間，轉動厚度控制按鈕，降低標本位置，將刀片前進到組織塊時，調動控制按鈕上升到能接觸刀片時，開始時試切幾次，先切厚片子，可切50－100微米。如果組織太細軟或從載物臺上松動須停止切片，通常切出的片子應視清潔的浮在水中，將刀片裝置退回到起點，從槽中取出。

有些組織如樹葉或根，放在標本臺為兩排或多排，可以一次切下，如果切下不適合的片子，可以把它去掉。切出理想的片子，用載物玻璃在水中撈起，用細玻璃棒幫助展開，如果喜歡的話，用小滴灌吸進片子，然后放在載玻片上，用粘片劑粘上，染色或作別的處理和封蓋。像用在冰凍標本的方法一樣，某種標本ZUI好的結果，應記錄下來，為類似工作的參考。